README
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Dependencies
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Modules
sratoolkit v.2.9.6 (Requires Bioinformatics) R v.3.6.1 R packages
tidyverse_v.1.3.0 dplyr_1.0.0 Hmisc_4.4-0 RcmdrMisc_2.7-0 reshape2_1.4.4 ggplot2_3.3.2 RColorBrewer_1.1-2 Rcpp_1.0.5 Other
mothur v.1.44.0 ML pipeline code ####################
Preparing Data
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Running the Pipeline
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