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05_validation.md

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既発表 RCT に対する synthdiet のバリデーション

synthdiet.validation はシミュレータ全体を、既発表の試験結果の パネルに対して実行します。期待される効果は査読付き論文に基づいて おり、引用とともに文書化されています。

同梱ターゲット

ターゲット 引用 アウトカム 期待値
DASH-Sodium Sacks NEJM 2001;344:3-10 ΔSBP (mmHg) -11.5
PREDIMED Estruch NEJM 2018;378:e34 ΔLDL (mg/dL) -6.0
DiRECT Lean Lancet 2018;391:541-51 Δ体重 (kg) -10.0
Look AHEAD Look AHEAD Diabetes Care 2007;30:1374-83 Δ体重 (kg) -7.9
DPP Knowler NEJM 2002;346:393-403 Δ体重 (kg) -5.5

すべてのバリデーションを実行

from synthdiet.validation import (
    validate_dash_sodium, validate_predimed, validate_direct,
    validate_look_ahead, validate_dpp,
)

for validator in (
    validate_dash_sodium, validate_predimed, validate_direct,
    validate_look_ahead, validate_dpp,
):
    report = validator(n_patients=120, seed=42)
    print(report.pretty())

CI での利用

バリデーションスイートは pytest 上で slow マーカーが付いて おり、通常テスト実行をブロックしません。実行例:

pytest -m slow tests/test_validation.py -v

失敗の解釈

FAIL は、シミュレータが文書化された許容差を超えて逸脱したことを 意味します。典型的な原因:

  • 疾患レスポンスモデルのリグレッション
  • デフォルト食事のマクロ栄養素変更によるバイオマーカーの逸脱
  • アドヒアランス/ドロップアウトの不足/過剰補正

既発表効果が誤りだと結論する前に、当該疾患の response_to_diet フックと Hall モデルのキャリブレーション定数を確認してください。