作者您好： 该程序使用conda安装bwa等程序，但是运行在集群等封闭式环境的状态下，很难使用，而且conda也无法简单安装bwa，picard等。另外，picard程序运行应该使用类似java -jar $picard 这种形式，怎么可以直接运行呢？可代码中却直接调用程序路径执行的方式，这种方式怎么可能成功运行？
作者您好：
该程序使用conda安装bwa等程序，但是运行在集群等封闭式环境的状态下，很难使用，而且conda也无法简单安装bwa，picard等。另外，picard程序运行应该使用类似java -jar $picard 这种形式，怎么可以直接运行呢？可代码中却直接调用程序路径执行的方式，这种方式怎么可能成功运行？