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cnvin/esmfold-image

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ESMFold Slurm Prediction Pipeline

这个仓库包含了在超算集群(HPC)上使用 SLURM 作业调度系统和 Singularity 容器运行 ESMFold 进行蛋白质结构预测的脚本。

📌 目录结构建议

为了使脚本开箱即用,建议在集群的个人目录下保持如下结构:

esmfold-image/
├── esmfold-image-latest.sif       # Singularity 镜像文件 (注意:由于体积过大,未上传至 GitHub)
├── predict-root-singularity.slurm # SLURM 提交脚本
├── README.md                      # 本说明文档
└── example/
    ├── input/
    │   └── SWL.fasta              # 你的输入 FASTA 序列
    └── output/
        └── SWL/                   # 预测结果输出目录

#镜像获取:
# 进入仓库目录
cd esmfold-image

# 拉取最新的 ESMFold Singularity 镜像
singularity pull esmfold-image-latest.sif docker://biochunan/esmfold-image:root-devel

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